La Dirección de Auditoria Interna es un órgano asesor y fiscalizador que evalúa la aplicación de los recursos y el Sistema Institucional de Control Interno de conformidad con la normatividad aplicable, conforme a principios de transparencia, acceso a la información y rendición de cuentas, para alcanzar los objetivos y metas del Plan de Desarrollo Universitario, enfocados a la satisfacción de sus usuarios y partes interesadas, con una gestión institucional de calidad, ética y trabajo en equipo.

Al 2025 la Dirección de Auditoria Interna, es un órgano asesor fiscalizador ampliamente reconocido por la comunidad universitaria y sociedad en general, que coadyuva en el seguimiento del Sistema Institucional de Control Interno, la transparencia el acceso a la información y la rendición de cuentas; se mantiene la mejora continua de sus procesos certificados con la Norma Internacional ISO 9001:2015, con un equipo de trabajo comprometido con la gestión institucional de calidad; cuenta con la infraestructura y tecnología suficiente en beneficio de sus colaboradores, como lo es el aprovechamiento de las Tecnologías de la Información y Comunicación, lo que impacta en el aumento de la satisfacción de usuarios y partes interesadas.